康熙十二年（1673年），正當(dāng)俞益謨回到家鄉(xiāng)“后選”之時(shí)，鎮(zhèn)守云南的平西王吳三桂，舉兵叛清自稱“周王”。陜西提督王輔臣、固原道陳彭等同時(shí)宣布反清，與吳三桂南北遙相呼應(yīng)。一時(shí)間，陜甘許多重要城池被反清軍攻占，清朝在西北的統(tǒng)治岌岌可危。此時(shí)寧夏兵將大多調(diào)征四川，“留者什之一二，人情惶迫，眾議紛紜。”俞益謨在康熙十四年（1675年），西北大局動搖的關(guān)鍵時(shí)刻，參加到寧夏總兵官陳福部下。在平定寧夏兵變的勘亂中表現(xiàn)忠勇，事平論功“授柳樹澗堡守備，”成為清軍一名下級軍官。陳福死后，清廷任命天津總兵官趙良棟到寧夏處理善后，首任寧夏提督。康熙十九年（1680年），寧夏和整個(gè)西北大局平定以后，清廷命趙良棟率部入川對吳三桂叛軍作戰(zhàn)，俞益謨隨趙從征。又因英勇善戰(zhàn)，屢立戰(zhàn)功，被破格賞“加一十七等，授左都督，管達(dá)州游擊事”，并“攝順慶郡篆”。康熙二十六年（1687年）升任廣西郁林參將，三十一年（1692年）再升兩江督標(biāo)中軍副將。

康熙三十四年（1695年），北方蒙古準(zhǔn)噶爾部叛亂首領(lǐng)噶爾丹，再次舉兵南犯，寧夏地區(qū)成為征討噶爾丹的軍事前沿陣地和軍需、兵源的補(bǔ)給基地，一時(shí)間各路大軍云集寧夏。這年冬季，康熙皇帝召見了俞益謨，賞賜“五爪龍袍、龍緞”，命他回寧夏參加征討噶爾丹軍事行動。他在寧夏參予辦理一段糧運(yùn)之后，就率部擔(dān)當(dāng)征討噶爾丹大軍的前鋒，在殺敵戰(zhàn)斗中屢屢建功。三十五年（1696年）春，被康熙再次召見，升任大同鎮(zhèn)總兵官。次年春，康熙皇帝親征噶爾丹，在赴寧夏閱兵途中，路過大同和四十一年（1702年）二月，康熙巡視山西五臺縣射虎川時(shí)，又兩次受到召見。康熙皇帝前后賞他很多御用珍品，還親筆仿米芾和趙孟頫的字體，給他題書“焜耀虎符”四個(gè)大字。在當(dāng)朝文武大臣中，享受如此“頻頻寵渥，浩蕩難名”，可算榮殊恩極了。四十二年（1703年）正月，湖廣提督林本植所部標(biāo)兵嘩變，朝廷“以俞益謨?yōu)楹V提督”，授權(quán)“提督湖廣全省軍務(wù)，統(tǒng)轄漢土官兵，兼軍衛(wèi)土司，控制苗彝，節(jié)制各鎮(zhèn)總兵官，左都督加六級。”他只帶領(lǐng)少數(shù)親信官兵，馳驛湖南，“僅半月，馳抵武陵，鎮(zhèn)定嘩卒，”妥善處理完兵變善后事宜。同年八月，又撫平“紅苗作亂”事件。在湖南任間，曾“多所建白，皆合戎政機(jī)宜。其談兵料敵，言無不應(yīng)。趙勇略、王奮威諸宿將，并稱其能。”甚至當(dāng)時(shí)“廷臣眾薦，才兼文武，堪應(yīng)總督之任”。康熙四十八年（1709年）九月，他與湖南巡撫趙申喬發(fā)生矛盾，撫督相互參劾。康熙皇帝對于兩位鎮(zhèn)撫封疆大員的失和攻訐十分生氣，認(rèn)為“有乖大體”，一怒之下，將二人都停職審查。令湖廣總督郭世隆負(fù)責(zé)查辦，派吏部尚書蕭永藻、都察院左副御史王度昭參加會審。查辦的結(jié)果是：雙方“所參俱實(shí)”。康熙皇帝對二人同時(shí)給予處分：“俞益謨著休致，趙申喬著革職留任”。俞益謨回到寧夏廣武家中，成為一名老百姓。在此期間，他一邊讀書，一邊整修水利、舉辦義學(xué)、主修鄉(xiāng)志等，成了名傳千古的歷史人物。在明代以前，整個(gè)寧夏，因歷史沿革變幻不定、戰(zhàn)亂頻繁及史志人員匱乏等諸多原因，也一直沒有自己的地方專志，更別說廣武營這個(gè)既非郡亦非縣的軍事堡寨了。但俞益謨撰修的《康熙朔方廣武志》。卻是寧夏古代唯一的一部地方鄉(xiāng)志，深為世人稱道。《康熙朔方廣武志》翔實(shí)地反映了廣武的地理風(fēng)貌和屯田戍守的特點(diǎn)，也對俞氏一門的“文武功德”有詳盡的記述，成為我們了解寧夏古代文化、經(jīng)濟(jì)、政治等方面極有價(jià)值的史料之一。

康熙五十二年（1713年）三月，康熙皇帝為了隆重慶賀自己的60大壽，詔諭全國，已60歲以上的獲罪受到處分的官員，凡能來京祝壽者，俱著恢復(fù)原品，賜御宴。俞益謨便放下自己的60壽慶不做，即時(shí)趕赴北京去給皇上賀壽。他在京又一次受到康熙的召見，并向皇上“呈進(jìn)方物”。康熙不僅開恩賜還了他的頂戴，還顧念他過去的功勞，又加封了榮祿大夫一品散官榮銜。俞妻張氏，亦被賜封為一品夫人。他的曾祖父俞大河、曾祖母曹氏；祖父俞天義、祖母張氏；父親俞君輔、母親趙氏等，都被追封榮祿大夫和一品夫人。俞家頓時(shí)滿門生輝，光照塞上。但是，樂極生悲，就在大慶當(dāng)日，俞益謨參加完賀壽典禮之后，回到寓所等待賜御宴之時(shí)，因連日勞累和興奮而猝逝于館舍。享年60歲。歸葬于寧夏廣武營城西南3里的蔭子山。

俞益謨“平生不蓄私囊”，有“樂施樂育之義”，熱心于家鄉(xiāng)的公益事業(yè)，“瞻顧?quán)徖?a href='http://www.eszhoucheng.cn/guoxue/644.html' target='_blank'>鄉(xiāng)黨，浚渠設(shè)塾，在在有記”。其中以整修水利、舉辦義學(xué)和主修鄉(xiāng)志等三件大事為代表為家鄉(xiāng)做了3件好事。

廣武鄉(xiāng)人民為了紀(jì)念這位為家鄉(xiāng)帶來驕傲和幫助的名人，特在城中建立牌坊，上有康熙皇帝御書欽賜的“焜耀虎符”四個(gè)大字。還在牛首山專為他修建一座“青銅君祠”。