在學術上，費密以漢儒為宗，力倡實學，反對宋儒空虛疏狂的積習，對其抹煞漢唐諸儒的功績表示異議。費密肯定漢唐諸儒在學術上的成就和貢獻，對宋明理學的“道統論”進行深刻的批判，在開創清代學風上起了“導夫先路”的作用，在清代學術史上具有重要的地位。

費密學識淵博，詩文亦頗有建樹。他繼楊升庵之后為中華和巴蜀文化做出了卓越的貢獻。他的詩題材廣泛，法度謹嚴，“以深厚為本，和平為調，以善寄托為妙，常戒雕巧快心之語”。清初蜀中談詩者，首推費氏為大家。費密與遂寧呂潛、達川唐甄合稱“清初蜀中三杰”。費密的詩現存55首，大多抒寫親身經歷，感情真摯，意境深遠，文筆清新，樸實自然。他的《朝天峽》一詩深受當時著名學者兼詩人王士禎的贊賞，稱其中|“大江流漢水，孤艇接殘春”兩句為“十字堪千古”。1958年，毛澤東主席在成都會議期間，所圈閱唐、宋、明朝人歌詠四川的一些詩詞中，就有費密的《朝天峽》。費密之子錫琮、錫璜也都以詩文著名于世，錫琮有詩集《白鶴樓稿》，錫璜有《掣鯨堂詩集》和《貫道堂文集》。

費密生逢戰亂，長期寓居江南，不能回歸故鄉，曾請著名畫家石濤繪《繁川春遠圖》寄托鄉思。故鄉人民也沒有忘記這位先賢。清道光八年（1828），新繁知縣馬裕霖在新繁城南建費公祠，1922年，新繁知事劉咸煊將費公祠移建于東湖，擴大規模，更名“四費祠”，以紀念費氏四代六位鄉賢。