萬樹一生創作傳奇和雜劇20余種，其中《擁雙艷三種》傳世今存。

有傳奇8種《風流棒》、《空青石》、《念八翻》、《錦塵帆》、《十串珠》、《黃金甕》、《金神風》、《資秦》。

雜劇八種：《珊瑚毯》、《舞霓裳》、《藐姑山》、《青錢賺》、《焚書鬧》、《罵東風》、《三茅宴》、《玉山庵》。

還作有《堆絮園集》、《香膽詞》和《璇璣碎錦》等。

在詞學上的成就就是編纂《詞律》20卷。這部曾得到無錫侯文燦協助而成的巨著，共收唐、宋、金、元詞660調，1180余種體。是當時詞體最詳，資料豐富，考訂最細的一部詞譜。吳衡照《蓮子居詞話》中說：“萬紅友當榛枯之時，為詞宗護法，可謂功臣。”乾嘉樸學大師以精研著稱的安徽歙縣凌廷堪，在其《梅邊吹笛譜》秋日舟過荊溪時所作《湘月》詞的序里，深以“萬氏之說與古暗合也”而表示敬佩。并以隔代知音身份緬懷這位先輩“空想堆絮園中，停樽按拍，制新詞如錦。律比申商，料后世應有知音題品!”

萬樹所作的《璇璣碎錦》圖文并茂，情趣盎然，收有60幅各種圖形的回文詩。這些饒有趣味的回文詩，有的可跳著讀，有的可疊著讀，皆朗朗上口，形象生動。萬樹的詞有《香膽詞選》6卷500首，為五種詞稿之一。萬樹的詞純情自然，多流動活潑的機趣，雅韻和俗美兼備，有的近于樂府古體和南北朝民歌韻味。如《生查子·家書》：“三載住京華，百度家書寄，為念孟光愁，不盡叮嚀意。今日離鄉關，回首無牽系，索性沒家書，省得書中淚。”萬樹用一種頂針疊句作詞，稱為“堆絮體”，頗有特色。這與他擅長作曲有關，但又不同于詞曲雜淆，可謂創新之舉。如《蘇幕遮·離情》：“彩分鸞，絲絕藕。且盡今宵，且盡今宵酒。門外驪駒聲早驟，惱殺長亭，惱殺長亭柳。倚秦箏，扶楚袖。有個人兒，有個人兒瘦。相約相思須應口，春暮歸來，春暮歸來否?”

萬樹還有一種所謂“獨木橋體”，其名篇《賀新郎·三舒先生傳贊》和同調《游石亭記——問家僮》，以否字押韻一韻到底作詞，真是“作者見奇，讀者稱妙”。他在長期的創作實踐中形成了自己多種多樣的風格，也填過大部分詞牌，雖用比興手法而無曲晦之感，基本格調仍是清疏放逸。日本漢學家青木正兒在《中國近世戲曲史》中稱：“萬樹之才，足與孔尚任翱翔;其曲律可比洪，能兼二者之長者也。”乾隆時楊復吉刻《昭代叢書》時還提及萬樹其它著作近10種，可惜均已失傳。

萬樹，字花農，一字紅友，江蘇宜興人。生卒年均不詳。他工詞善曲。康熙朝吳興祚總督兩廣，愛其才，延至幕府，一切奏議，皆出其手。暇則制曲，甫脫稿，興祚即命家伶演以侑觴。終以懷才不遇，郁郁以終。樹所作曲，共有二十余種，今僅可考見其劇名十六種。計雜劇八種，為珊瑚珠、舞霓裳、藐姑仙、青錢賺、焚書鬧、罵東風、三茅庵及玉山宴。傳奇八種，為風流棒、空青石、念八翻、錦塵帆、十串珠、萬金甕、金神鳳及資齊鑒。《曲錄》其中風流棒、空青石、念八翻三種合刻為一集，名為擁雙艷三種，比較有名。又以《詞譜》舊圖名棼亂，成《詞律》二十卷。又著有堆絮園集、香膽詞及璇璣碎錦，并傳于世。

清康熙二十七年(1688年)，終以懷才不遇，憂郁積勞成疾，拜辭吳興祚回鄉，不幸病死于廣西江舟旅途中，終年僅58歲。另有一說他約公元1692年前后(清圣祖康熙中前后)在世。遺作有戲曲20余種，僅存傳奇《風流棒》、《空青石》、《念八翻》3種，合刻為《擁雙艷三種曲》;詩文集《堆絮園集》、《花濃集》也已失傳，僅存《璇璣碎錦》、《香膽詞》傳世。